Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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