Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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