Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms