Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms