Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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