Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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