Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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