Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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