Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms