Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms