Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms