Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms