Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOX4Q06945 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOX4Q06945 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms