Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms