Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms