Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms