Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms