Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms