Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC10Q01780 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms