Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms