Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms