Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA52P62987 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA52P62987 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA52P62987 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms