Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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