Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms