Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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