Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms