Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK1P57059 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms