Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms