Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms