Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTTPP55157 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms