Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms