Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP153P49790 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms