Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms