Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms