Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms