Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPS1P31327 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms