Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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