Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms