Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms