Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR4A1P22736 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms