Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT1P21579 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms