Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms