Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms