Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX4I1P13073 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms