Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8BP10966 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms