Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms