Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8AP01732 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8AP01732 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD8AP01732 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms