Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms