Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms