Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms